Histcite Pro 详细教程 文献引文关系分析利器V2.1
留学生代写为您带来的是 HistCite 是一款非常强大的 Windows 平台引文分析工具,可以根据 Web of Science (WOS)数据库上导出的数据快速绘制出某个研究领域的发展脉络,快速锁定某个研究方向的重要文献和学术大牛,还可以找到某些具有开创性成果的无指定关键词的论文。
由于 HistCite 的原开发者已经停止更新了,因此经常会出现各种各样的问题,例如直接导入 WOS 上的数据文件总会出现错误,因此,我之前开发了一款精简易用的免安装版本 Histcite Pro 2.0,但主要的分析功能还是基于 Histcite 内核运行。下载压缩包解压后就可以直接用,不需要安装,同时去掉了很多没用的文件,大大缩小了软件体积。对于从WOS上导出的txt数据文件,不用做任何修改,只要把全部的txt放到 TXT 文件夹里面,然后双击 main.exe 即可一键完成加载,非常方便。
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但是,最近有多位用户反馈 Histcite Pro 2.0 出现了打开速度过慢的问题,光标一直在闪烁,但迟迟不出现提示信息,甚至出现了无法正常使用的情况,在这里我向大家致以诚挚的歉意!距离上个版本(2.0)的发布有两年了,在上个版本中,我加入了云端收集用户 IP 地址的功能,主要是了解用户的覆盖情况,不过后来接收信息的服务器接口关闭了,所以该功能其实一直也处于报废状态,而这不怎么影响用户使用,所以也没有进行版本更迭。但是最近由于获取 IP 的 API 频频出现故障,导致软件打开时一直在尝试连接,从而导致程序卡顿。
为了更好的提高用户体验,在 2.1 版本中我彻底删除了这个云端收集信息的功能,因此本软件彻底成了本地程序,不仅体积有所减小,运行速度也得到了提升!大家可以去网盘下载最新版试用,具体的使用方法可以到上面的知乎专栏页面查看。
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Histcite Pro 2.1 网盘下载地址:https://pan.baidu.com/s/1hsIwJzQ
1. 工具介绍
如果你选修过中国科学技术大学罗昭锋(微博主页:https://weibo.com/science20)老师的《文献管理与信息分析》,那么你一定不会对HistCite 感到陌生,这是一款非常强大的引文分析工具,可以快速绘制出某个研究领域的发展脉络,快速锁定某个研究方向的重要文献和学术大牛,还可以找到某些具有开创性成果的无指定关键词的论文。
如果说一次引用表示给你的文章投一票,那么并不是所有票都有效,只有相同领域文章的引用才能真正体现你在这个领域中的实力。所以在 Web of Science (以下简称 WOS)上按照被引次数倒序排列,越靠前不一定就越重要。还有一种情况,你发明了某种材料,但是后来名字变了,之后的文章使用的关键词都是新名字,别人搜新名字的关键词是搜不到你的开创性文章的,但是很显然你的文章是非常重要的。通过 HistCite 可以直观的看出这个研究领域的论文全部引用了你的文章,可以体现你的文章的重要性。
好了,下面开始使用这个工具。首先要了解一点,HistCite 这款软件是 Thomson Reuters (汤森路透)公司开发的,和 WOS 是一家公司,所以 HistCite 只支持 WOS 数据库,对于 Scopus 等数据库则无能为力,不过 Github 上面有人写了一个可以将 Scopus 导入 Histcite 进行分析的脚本——Scopus2Histcite(https://github.com/leoatchina/Scopus2Histcite),有兴趣的同学可以去试试看。
2016年10月,汤森路透知识产权与科技业务被 Clarivate Analytics (科睿唯安)公司收购了,从此 WOS 也是归该公司所有,因此导出的数据纯文本也发生了些许变化,从而不能直接导入 HistCite 进行分析。不过别担心,HistCite Pro 完全兼容新的文件格式!
打开WOS,注意数据库要选择核心合集(Core Collection)!
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例如简单检索一下石墨烯在锂离子电池负极中的应用:
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检索结果不是太多,可以全部导出,如果文献太多的话,可以先按照被引频次降序排列,只导出前2000篇就差不多了。
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下面开始导出文献信息,点击页面上的【保存至 Endnote Online】按钮右边的下拉按钮,选择【保存为其他文件格式】。
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在弹出的菜单中,记录数填写1到500,因为每次最多只能导出500篇文献,所以上面的2819篇文献需要分成6次导出,后面导出的时候依次填写501到1000、1001到1500等等。。。记录内容选择【全记录与引用的参考文献】,文件格式选择【纯文本】,然后点击发送即可得到导出的 txt 文件,类似可以导出其他5个。
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注意:含500个记录的txt文档一般是3M左右,如果你的只有几百K,请仔细按照上面这张图进行导出!!!
下面使用 HistCite 来分析这6个txt格式的引文数据文件。由于 HistCite 多年不更新,现在存在各种 Bug,比如直接打开 HistCite,一加载文件就报错:No such file or directory。对于这种情况,你可以选择在 C 盘根目录下新建 fakepath 文件夹,然后将全部的 txt 文档复制到里面,再打开 HistCite 来进行加载,但是仍然会遇到下面 Format Unknown 的问题。
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尝试第二种方法。选中所有的 txt 文件,然后拖到 HistCite 的图标上,放开鼠标,果然自动打开了软件。
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但是,事情好像并没有那么简单,又出现了一个报错:Format Unknown。
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最后,在罗老师的指引下,我将每个 txt 文件的第一行中的 Science 改成了 Knowledge。
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然后再将 txt 文件拖放到 HistCite 图标上面打开,终于成功加载了!
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可以看到2819篇文献信息全部加载进来了。
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在受到这么多折磨之后,我用 Python 开发了一个方便使用的脚步,于是一个以 HistCite 源程序为核心的精简易用免安装版本问世了,就叫 HistCite Pro 吧。
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由于 HistCite 源程序只支持 Windows 系统,所以 Pro 版本也只能在 Windows 下使用!
你只需要下载 HistCite Pro 的压缩包(下载链接见文末)并解压(建议解压到 C 盘或者 D 盘的根目录下,保证路径中不含中文),就可以直接用,不需要安装,同时去掉了很多没用的文件,大大缩小了软件体积。对于从WOS上导出的txt数据文件,不用做任何修改,只要把全部的txt放到 TXT 文件夹里面,然后双击 main.exe 即可一键完成加载,非常方便。
![文献引文关系分析利器 Histcite Pro 2.1](https://www.excellentdue.com/wp-content/uploads/2020/05/e02a427338004775826c68beaa46ee75.jpg)
好了,数据加载完毕,下面开始分析数据吧,点击 Tools 菜单下的 Graph Maker。
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在弹出的页面上点击 Make Graph 即可得到一张引文关系图,包含了最有价值的前 30 篇文章的完整引文关系。
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这张图看起来不是很清楚,在左边的Size选项中选择 Full 模式,重新绘制一张高清图,然后右击图片“另存为”一张图片即可。
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图上有 30 个圆圈,每个圆圈表示一篇文献,中间的数字是这篇文献在数据库中的序号。圆圈越大,表示被引用次数越多。不同圆圈之间有箭头相连,箭头表示文献之间的引用关系。多数情况下,你会看到最上面有一个圆圈较大,并有很多箭头指向这篇文章。那么这篇文章很可能就是这个领域的开山之作。
通过我绘制出的这张关系图,我们发现标号为29、49、56、60的四个大圆圈非常显眼,可见这四篇文献的被引次数都是非常高的,我们对全部文献进行按照 LCS 排序,发现前四位刚好就是这 4 篇文献。
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再回到那张圆圈箭头关系图,可见石墨烯在锂离子电池负极材料中的应用研究主要起源于2008年(29号文献),其通讯作者Honma来自日本,看来日本在石墨烯电池方面的研究开展得相当早。之后,在2010年,很多原创性的成功迸发而出,具有代表性的就是49、56、60、48号文献,非常有趣的是,2010年诺贝尔物理学奖的获奖项目刚好是石墨烯,其中的关联显而易见。之后的几年,石墨烯在锂离子电池负极方面的研究越来越多,方向约越来越细。
好了,前面提到HistCite可以找到某些具有开创性成果的无指定关键词的论文,我们来看看是怎么办到的。点击页面上的【Cited References】,然后就可以看到本地库中文献参考的全部文献信息,后面带有加号的表示本地txt库中没有包含,这些往往就是被遗漏的重要文献。
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同样的,我们点击上面的【Authors】按钮,可以找到本领域的一些大牛,具体的操作步骤读者可以自己去摸索。
那么我们怎么把文献记录导出到Endnote呢?首先点击菜单栏中【Tools】下的【Mark&Tag】选项,调出标记选择工具栏。
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下图红框内就是标记选择工具栏。左边栏用于指定选择范围,可以选择当前列表中的全部文献,也可以按照序号(#)、LCS、LCR等数值的区间来选择文献,还可以手动勾选需要的文献。中间栏表示的是需要导出的信息范围,可以只导出记录本身,也可以选择导出引用的文献或者被引的文献。右边栏的【Mark】按钮就是确认选择按钮。
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所以,我们选择好了需要导出的文献记录,点击【Mark】按钮。
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然后,我们就会发现上面出现了一个新的标签【Marks】,后面的数字就是我们选中的记录条数,如果发现这个数字不正确,点击【Mark】按钮旁边的【Unmark】来重新选择。确认无误之后,点击图示的【Marks】标签链接,即可显示全部被选的文献记录。
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好的,下面依次点击【File】、【Export】、【Records…】来导出选中的文献记录。
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成功导出后得到一个 .hci 格式的文本文件,直接修改后缀为 txt。如果导出不成功,一般多尝试几次就可以。
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好的,现在我们打开Endnote,依次点击【File】、【Import】、【File…】按钮。
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在弹出的对话框中通过【Choose…】找到刚才的txt文件,【Import Option】选择 Multi-Filter (Special),【Duplicates】选择 Import All,然后点击【Import】按钮即可导入。
![文献引文关系分析利器 Histcite Pro 2.1](https://www.excellentdue.com/wp-content/uploads/2020/05/c05126f9bdf34bc5a83ce70e2fadd7f2.jpg)
评论中沈曦同学提到了将 HistCite 选好的文献导入到 Noteexpress 软件里的方法,具体操作是在导入时将过滤器选择为 web of science。
最后附上HistCite里面几个重要的英文缩写(感谢Dingledodies同学):
GCS(global citation score), 某一文献在WOS数据库中的总被引用次数。有些引用这篇参考文献的文章可能和你的研究方向毫无关系,但GCS还是会把这个引用数据记录下来。
LCS(local citation score),某一文献在本地数据集中的被引用次数。因为你导入Histcite的文章都是和你检索词有关系的,可以认为这些文章是你的研究同行,因此如果某一篇文献的LCS值很高,就意味着它是你研究领域内的重要文献,很有可能是你领域内的开创性文章,注意LCS高的文献和GCS高的文献不一定是同一篇!
LCR(local cited references), 某一文献引用本地数据集中参考文献的数目。根据LCR值的排序,可以快速定位近期关注该领域的重要文献,因为某一篇文献引用当前数据集中的文献数越多,说明它非常关注你检索的这个研究方向的文献,和你的研究肯定有相似或者可参考之处,可以从该文章中发现新动向。
CR(cited references), 某一文献引用WOS数据库中参考文献的数目。这个值越高,说明这篇文献很可能是综述性文献,可根据该值的排序,也可快速定位综述文献。
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